Главная страница 1
скачать файл

Моделирование биосинтеза хромофора зеленого флуоресцентного белка
методами квантовой химии
1

Миронов Владимир Андреевич

Аспирант

Московский государственный университет имени М.В.Ломоносова,

химический факультет, Москва, Россия

E–mail: vladimir.a.mironov@gmail.com

В настоящее время большое внимание уделяется флуоресцентным белкам, нашедшим широкое применение в клеточной биологии в качестве флуоресцентных маркеров [1

. ..Rev.Biochem.ent proteinимический методовциклизация и окислительная дегидратация.омофора белка тков.ения.ологии в качестве ]. Одним из преимуществ меток такого типа является то, что для флуоресценции им не требуются какие-либо кофакторы [2]. Оптические свойства таких белков обусловлены только присутствием в их строении особой хромофорной группы, образующейся в результате автокаталитической циклизации и последующего окисления молекулярным кислородом последовательности из трех аминокислотных остатков, расположенных в центре белка. Скорость протекания этой реакции, а также структура и спектральные характеристики зрелого хромофора в значительной мере зависят от его белкового окружения. Понимание процесса биосинтеза важно для направленного синтеза флуоресцентных белков с заданными свойствами. В настоящий момент известна лишь общая схема протекания данного процесса, детали его неизвестны.

Рисунок 1. Схема реакции образования хромофора белка EGFP.



Данная работа посвящена исследованию возможного пути протекания биосинтеза хромофора белка EGFP. С помощью современных методов вычислительной химии исследованы основные стадии данного процесса: циклизация и окислительная дегидратация2. Для последней стадии проанализированы различные пути данного процесса. Исследовано влияние остатков Arg96 и Glu222 на процесс протекания реакции. Показаны основные этапы стадии окисления: депротонирование прекурсора хромофора, перенос электрона на молекулу кислорода на ППЭ триплетного состояния, триплет-синглетный переход и образование продукта.

Литература

  1. Tsien, R.Y. The green fluorescent protein // Annu. Rev. Biochem. 1998, № 67, p. 509–544.

  2. Craggs, T.D. Green fluorescent protein: structure, folding and chromophore maturation // Chem. Soc. Rev. 2009, № 38, p. 2865–2875.

1 Данная работа поддержана грантом Президента Российской Федерации (MK-64815.2010.4).

2 Большая часть расчетов была выполнена с использованием ресурсов суперкомпьютерного комплекса СКИФ-МГУ «Чебышев».
скачать файл



Смотрите также:
1 Миронов Владимир Андреевич
19.47kb.
Миронов О. Г. Рецензия на серию программ по экологическим и гидробиологическим дисциплинам, опубликованных в Ecological Studies, Hazards, Solutions, 2006, vol. 11 с
23.7kb.
Избирательная урна Избирательный участок
13.37kb.
Бараев владимир васильевич
297.79kb.
Название в моей смерти прошу винить клаву к
14.73kb.
Владимир Сергеевич Локтев родился 11 мая 1911 года. Его именем назван Ансамбль песни и пляски, которым он руководил
15.76kb.
Управление образования Администрации Тисульского района Дом детского творчества Репрессированные немцы в Тисульском районе Работа на VI школьную научную практическую конференцию
337.32kb.
Владимир Владимирович Петров Мир лесных растений Человек и окружающая среда – Петров Владимир Владимирович Мир лесных растений
1885.61kb.
Сокращенный вариант действительный член Российской Академии Наук
176.29kb.
Николай андреевич римский-корсаков боярыня вера шелога опера в одном действии
85.94kb.
8 апреля 2013 года, при осмотре стендов международной выставки федеральный канцлер Германии д-р Ангела Меркель посетила стенд компании Festo. В этом году канцлера сопровождал президент России Владимир Путин
34.73kb.
Открытие семинара Владимир Юрьевич Ряшенцев
51.79kb.